Secretaría General tiene la misión de proporcionar servicios de asesoría en la aplicación de protocolos legislativos y ejecutivos para formalizar la toma de decisiones del Consejo Provincial y la Prefectura, y definir políticas y servicios de manejo documental.
La Secretaría General tiene nivel de Dirección.

Portafolio de Productos.- El portafolio de productos finales de la Secretaría General es el siguiente:

a) Asesoría en la aplicación de protocolos y coordinación operativa y de despacho de la documentación del GAD de la Provincia del Carchi.
b) Asesoría en la aplicación de protocolos y coordinación operativa y de despacho del Pleno del Consejo Provincial.
c) Archivo central
d) Los demás productos finales previstos por la Constitución, las leyes, la normativa interna y las disposiciones de las autoridades.

Estructura organizacional.- La Secretaría General no tiene estructura organizacional en su interior, sino que se administra sobre la base de equipos de trabajo.